解碼棉花基因組能深入知道棉花種的起源進化及棉花重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎(chǔ),華中農(nóng)業(yè)大學棉花遺傳改良團隊聯(lián)合海外研究團隊,共同解析異源四倍體培植種陸地棉與海島棉的參考基因組序列,為棉花基因組進化與功能基因研究提供重要參考。國際權(quán)威期刊《自然-遺傳學》3日在線發(fā)表這一新研究成果。
陸地棉與海島棉是當前棉花生產(chǎn)上主要使用的兩個異源四倍體培植種,陸地棉產(chǎn)量高,適應性強,海島棉的產(chǎn)量低,但其纖維品質(zhì)比陸地棉優(yōu)。雖兩個棉花的基因組草圖已發(fā)表,但由于組裝質(zhì)量與盡整性不高,到底哪些基因組片段操縱海島棉優(yōu)異纖維品質(zhì)的形成等向來不清晰。
為得到精細的基因組序列,這項研究利用第三代測序技術(shù)、光學圖譜技術(shù)與上色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)捕獲技術(shù)進行聯(lián)合組裝。和此前新發(fā)表的基因組草圖相比,這項研究組裝的基因組序列,在延續(xù)性與盡整性上有極大提高,陸地棉基因組、海島棉基因組的延續(xù)性分離提高55倍、90倍。
華農(nóng)棉花遺傳改良團隊負責人張獻龍教授介紹,這項研究成功組裝高度重復的基因組區(qū)域,通過比較兩個棉花四倍體種的基因組,發(fā)覺二者存在大量的結(jié)構(gòu)變異。兩個異源四倍體培植種各有26對上色體,研究發(fā)覺,兩個棉花種的14條上色體之間存在上色體臂內(nèi)與臂間的大片段倒位現(xiàn)象,也就是說“兩個棉花種之間基因組差異很大”。
為基于棉花基因組的纖維遺傳改良研究,科研人員還對陸地棉與海島棉之間的遺傳導入系材料進行基因組分析,鑒定13個操縱纖維品質(zhì)的遺傳位點,探索遺傳位點的表達調(diào)控機制。這項研究為今后通過海島棉改良陸地棉的種間漸滲育種提供參考。
來源:新華網(wǎng)
標題:科研人員繪制出陸地棉與海島棉的參考基因組
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